Les assaillants ont frappé dans la nuit de samedi à dimanche dans la commune de Seytenga, qui fait partie de la province de Seno, située dans les zones frontalières où des militants liés à Al-Qaïda et à l'État islamique mènent une insurrection.
Une source de sécurité a déclaré à Reuters qu'au moins 100 personnes avaient été tuées.
Une source locale qui ne souhaite pas être nommée a déclaré que le bilan provisoire s'élevait à 165 morts.
Les Nations Unies ont condamné l'attaque qui a "fait de nombreuses victimes" dans une déclaration lundi et ont appelé les autorités à traduire les auteurs en justice.
Le gouvernement devrait fournir un bilan des morts plus tard dans la journée de lundi.
Les violences liées aux insurgés islamistes ont fait des milliers de morts et des millions de déplacés à travers le Burkina Faso, le Mali et le Niger voisins depuis 2015.
