Bionano Genomics annonce une publication du Consortium international sur les variations structurelles du génome de l'hôte de COVID-19 décrivant comment l'OGM a identifié des variations structurelles comme facteurs prédisposants associés à COVID-19 sévère.
Le 20 janvier 2022 à 14:00
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Bionano Genomics, Inc. (BNGO) a annoncé la publication d'une étude décrivant l'utilisation de l'OGM pour identifier des variantes structurelles génomiques (VS) humaines rares en tant que facteurs de prédisposition associés au COVID-19 sévère, soulignant le rôle potentiel des VS dans la pathogenèse de la sévérité du COVID-19. L'International COVID-19 Host Genome Structural Variation Consortium est un consortium mondial ouvert de variation structurelle du génome de l'hôte pour la réponse COVID-19. Il est composé de plus de 30 chercheurs d'institutions de premier plan qui utilisent des technologies de molécules à lecture longue, y compris l'OGM, pour évaluer les VS dans le génome humain qui pourraient contribuer à la susceptibilité ou à la progression du COVID-19. Dans cette étude évaluée par des pairs et publiée dans la revue iScience, les chercheurs ont réalisé une OGM sur des échantillons provenant de 52 patients atteints de COVID-19 gravement malades afin d'étudier les SV en tant que facteurs de prédisposition décisifs associés au COVID-19. Ils ont identifié 7 VS chez 9 patients (17% des patients testés) impliquant des gènes impliqués dans deux voies clés d'interaction hôte-viral : l'immunité innée et la réponse inflammatoire, et la réplication et la propagation virale. Selon les auteurs de l'étude, les VS dans deux gènes, STK26 et DPP4, sont les candidats les plus intrigants dans ces voies biologiques. Comme l'indiquent les auteurs, il s'agit de la première étude à évaluer systématiquement le rôle potentiel des VS dans la pathogenèse de la sévérité du COVID-19. Ces résultats indiquent que les VS peuvent être un facteur de sévérité du COVID-19 et élargissent la compréhension de la communauté des chercheurs sur la susceptibilité et la progression du COVID-19.
Bionano Genomics, Inc. est une société de génomique. Elle propose des solutions de cartographie optique du génome (OGM) pour des applications de recherche fondamentale, translationnelle et clinique. Par l'intermédiaire de Lineagen, Inc, la société propose également des tests de diagnostic pour les patients dont les présentations cliniques correspondent à des troubles du spectre autistique et à d'autres handicaps neurodéveloppementaux. Elle propose également une solution logicielle indépendante de la plateforme, qui intègre des données de séquençage et de microréseau conçues pour fournir une analyse, une visualisation, une interprétation et un rapport des variants du nombre de copies, des variants d'un seul nucléotide et de l'absence d'hétérozygotie sur l'ensemble du génome en une seule vue consolidée. La société propose également des solutions d'extraction et de purification d'acides nucléiques utilisant la technologie propriétaire d'isotachophorèse (ITP). La société commercialise et vend des systèmes OGM, notamment le système Saphyr, qui fournit des données OGM permettant la détection ultrasensible et ultraspécifique de toutes les classes de variations structurelles (SV).
Bionano Genomics annonce une publication du Consortium international sur les variations structurelles du génome de l'hôte de COVID-19 décrivant comment l'OGM a identifié des variations structurelles comme facteurs prédisposants associés à COVID-19 sévère.