NanoString Technologies, Inc. a annoncé la publication de nouvelles données générées par l'imageur moléculaire spatial (SMI) CosMxo. Ces données ont été générées à partir d'échantillons de foie humain fixés au formol et incorporés en paraffine (FFPE) et illustrent la qualité des données du CosMx SMI, la meilleure de sa catégorie. Le jeu de données met en évidence la haute sensibilité de l'IEM CosMx, avec la capacité de détecter et de quantifier une moyenne de 1 150 transcrits par cellule et de maximiser les connaissances biologiques en détectant 676 gènes uniques.

L'ensemble de données représente également la haute spécificité de CosMx SMI, avec plus de 99 % des comptes identifiés sur les gènes ciblés. CosMx SMI permet l'imagerie haute résolution de plus de 1 000 ARN et de plus de 64 analytes protéiques dans des coupes de tissus entiers morphologiquement intacts. L'instrument CosMx permet aux chercheurs de visualiser et de quantifier l'expression des gènes et des protéines à des résolutions unicellulaires et subcellulaires dans des échantillons de tissus frais congelés et FFPE.

En utilisant une approche multi-modalité, y compris l'imagerie des protéines, CosMx SMI fournit la meilleure segmentation cellulaire de sa catégorie. Cette analyse in situ high-plex permet également aux chercheurs de réaliser des analyses de typage cellulaire, d'état cellulaire, d'analyse fonctionnelle et d'interaction cellule-cellule en une seule expérience, générant ainsi des atlas cellulaires haute résolution. NanoString a utilisé l'IEM CosMx pour caractériser des tissus FFPE de foie provenant de patients normaux et atteints de carcinome hépatocellulaire.

Les données CosMx sur le foie humain fournissent une carte d'expression subcellulaire de 1 000 gènes et un atlas tissulaire unicellulaire qui catégorise chaque cellule du tissu comme l'un des 18 types cellulaires uniques. L'ensemble complet de données comprend plus de 800 000 cellules uniques et ~700 millions de transcrits, ainsi qu'un atlas tissulaire unicellulaire sur une zone de ~180 mm2 de tissu hépatique. L'analyse high-plex a permis de comprendre en profondeur les changements cellulaires et tissulaires qui se produisent dans le cancer, y compris l'infiltration de diverses cellules immunitaires.